Al igual que el resto de CMS, la gestión de usuarios del sistema e-learning requiere una atención inmediata. En primera instancia, se realizarán pruebas de validación utilizando distintos nombres de usuarios ("alumno", "profesor" o "administrador").
Por lo general, el propio sistema e-learning posee una base de datos propia en la que figuran los usuarios. Una de las tareas más frecuentes que suelen llevarse a cabo es el registro y el alta de cada uno. Sin embargo, existen ciertas herramientas que permiten, además, realizar una serie de tareas colectivas (por ejemplo, altas masivas de usuarios) mediante ficheros externos en formato CVS o de texto plano.
Hay que tener en cuenta además que se deben conceder permisos añadidos a algunos usuarios con un perfil determinado, como "profesor" o "alumno" (asignado por defecto en estas plataformas).
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